Reiji, un jeune garçon venant juste d'arriver en Amérique est témoin d'un assassinat. Ein, le tireur qui s'est fait repérer par alors à sa poursuite et s'apprête à le tuer lorsque son supérieur lui ordonne de le garder en vie car il possède un grand potentiel. Sa mémoire lui est alors effacée et un dur choix s'offre à lui : la mort ou devenir un assassin professionnel. Reiji choisi de vivre et un nouveau nom lui est donné : Zwei. Il subit alors un entraînement intense afin de devenir un Phantom tout comme Ein.