Kyoto, 1863. Le vent de la révolte attise les flammes d’un Japon en proie aux inégalités, dominé par la suprématie des natifs qui rejettent farouchement les étrangers. Nio, un jeune orphelin aux yeux bleus perçants et animé par un sens aigu de la justice, aspire à transformer en profondeur cette société. Sa rencontre avec Toshizô Hijikata et Sôji Okita, deux rônins appartenant au Shinsen Gumi et au groupe « Miburo », va raviver en lui les braises incandescentes de la rébellion, prêtes à embraser la nation tout entière.