Au Japon, une mystérieuse organisation du nom de Panther Claw sème la panique dans la ville de Tokyo. L'inspecteur de police Aki Natsuko est chargé de l'affaire mais elle se fait à chaque fois devancer par une mystérieuse personne à plusieurs facettes en habit de cosplayeuse : Cutie Honey. Cutie Honey est en réalité Kisaragi Honey, le résultat d'une expérience du professeur Kisaragi. Elle peut changer d'apparence à volonté, c'est la reine du déguisement. Afin de combattre l'organisation Panther Claw, Kisaragi se transforme en Cutie Honey pour devenir la guerrière de l'amour et de la justice.