L'hôpital New Amsterdam a la particularité de traiter, sous le même toit, une patientèle souffrant de la maladie à virus Ebola, des prisonniers d'un pénitencier à haute sécurité et le président des États-Unis. Cet établissement public sous-financé, véritable institution de Manhattan, est bouleversé par l'arrivée à sa tête d'un nouveau directeur, le Dr Max Goodwin, bien décidé à faire bouger les choses. Mais ses batailles seront multiples puisqu'il doit également lutter au quotidien contre le cancer qui le ronge.