Les ninjas chassent le mal depuis l'ombre. Les gokudo rassemblent des marginaux solitaires et commettent des crimes. La rancœur qu'ils ont forgée il y a des siècles renaît aujourd'hui. Le ninja Shinoha rencontre Kiwami, un gokudo au visage d'homme d'affaires. Ignorant l'identité de l'autre, ils se lient d'amitié autour de leur passion commune pour les anime, mais la guerre entre ninjas et gokudo s'intensifie. Qui survivra et qui périra, les ninjas ou les gokudo ?